Die Politische Gemeinde Pfäfers ist als Gemeinde mit Bürgerversammlung organisiert. Die Schule ist Teil der Gemeinde (Einheitsgemeinde). Der Schulratspräsident ist gleichzeitig Mitglied des Gemeinderates.
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Die Bürgerschaft wählt alle vier Jahre Gemeindepräsident/-in und Schulpräsident/-in sowie die Mitglieder des Gemeinderates, Schulrates und der Geschäftsprüfungskommission an der Urne. Die gewählten Behörden konstituieren sich selber.